1308 r. - Pierwsza wzmianka w dokumentach o istnieniu kościoła św. Jakuba. Informacja o pochówku rycerzy obrońców Gdańska przed zakonem krzyżackim na cmentarzu przy kościele.
XIV w. – Obok klasztoru cysterskiego powstał murowany, na miejscu wcześniejszego drewnianego, trójnawowy kościół parafialny pw. św. Jakuba.
1577 r. – Kościół został zburzony przez gdańskich żołnierzy.
1591 r. -1593 r. – Odbudowa świątyni w formie dwunawowej.
1604 r. – W dniu 18 stycznia Franciszek Łącki sufragan z Włocławka konsekrował kościół św. Jakuba.
1709 r. – Kościół zwieńczyła wieża o wysokości 24 metrów.
1833 r. – Po kasacie klasztoru cysterskiego w Oliwie (1831 r.) kościół klasztorny przekazany został katolikom jako parafialny a kościół św. Jakuba przyznany ewangelikom.
1879 r.-1882 r. – Przeprowadzono gruntowny remont kościoła.
1920 r. – Ewangelicy przenieśli się do nowo wybudowanego kościoła Pojednania w Oliwie.
1946 r. – Kościół św. Jakuba przekazano katolikom i do dnia dzisiejszego pełni on funkcję kościoła rektorskiego.
1960 r. – W ramach przeprowadzonej rewaloryzacji odsłonięto najstarsze partie muru na zewnętrznych ścianach z charakterystycznymi dla wiejskich kosciółków gotyckich wmurowanymi polnymi kamieniami.
1999 r. – Odnowiono kościół, pokryto go nowym dachem, naprawiono wieżę i pomalowano.
Obecny kościół św. Jakuba to dwunawowa niewielka świątynia. Ma 28 metrów długości, 10 metrów szerokości oraz 12 metrów wysokości. Wyposażenie kościoła stanowią ambona i ołtarz z drugiej poł. XVIII wieku. W ołtarzu jest obraz Chrystusa z 1853 roku, dzieło malarza gdańskiego L. Sy. Znajdował się on w gdańskim seminarium duchownym i obecnie powrócił na miejsce swego przeznaczenia. W posadzce zobaczyć można 6 płyt nagrobnych, w tym 4 z herbami. Wschodni szczyt budowli zdobi rokokowy kartusz z czasów opata Jacka Rybińskiego (1740‑1782).
Cmentarz przy kościele św. Jakuba nie istnieje już dzisiaj. Obecny oliwski założony został w 1878 roku. W 1909 r. wybudowano kaplicę cmentarną wg. planów architekta Singera, twórcy kaplicy św. Piotra w Jelitkowie.
Przy ulicy Grunwaldzkiej 517 w Oliwie stoi kapliczka św. Jana Nepomucena z XVIII wieku. Jest ona świadectwem pielgrzymek organizowanych przez Bractwo Drogi Krzyżowej, powołane w 1766 r. przez papieża Klemensa XIII. Po drodze z kościoła reformatów w Gdańsku Chełmie do Kalwarii Wejherowskiej było 14 stacji. Zachowana do dziś kapliczka z figurami Matki Bożej i św. Jana Nepomucena, zwana przez dawnych mieszkańców Oliwy Kolumną Maryjną, to niemy świadek religijności owych czasów.
[1] Z. Iwicki, Oliwa wczoraj i dziś. Przewodnik po zabytkach katedry i byłego klasztoru, Gdańsk 2001, ss. 234, 235